A 17 ans, Squall Leonhart a passé la plus grande partie de sa vie dans la Balamb Garden University, qui recueille les orphelins et se charge de les former en membres du Seed, une organisation de mercenaires idéalistes. Récente recrue du Seed, il est envoyé en mission et se trouve confronté à un conflit dépassant les limites de l'imagination, provoqué par une puissante sorcière venant du futur.