Sora est un jeune garçon, qui a pour amis Kairi et Riku. La vie sur leur île est agréable mais monotone, alors les trois amis décident de construirent un radeau pour découvrir de nouveaux mondes. Mais une nuit, une tornade surnaturelle vient décimer leur île, et ouvre un passage aux Sans-coeur, êtres sans foi ni loi prêts à tout pour semer le chaos. Pour se défaire de ces envahisseurs, Sora possède une clé qui lui servira aussi d'arme, la Keyblade. Aidé de Dingo et Donald, Sora part à la recherche de ses amis qui ont disparu.